广州医科大学综合档案室成立于1984年，归属学校办公室管理，由校长直接负责。目前，学校档案分有党群、行政、教学、科研、设备、基建出版、声像、外事、财会、人员、实物等十二大类；库存档案58310卷，19537件，资料2223册。编有本校组织沿革、大事记、规章制度汇编、基础数字汇编、党政发文汇编、领导干部名册、机构设置等编研资料526本。